会议介绍

        由华大基因学院主办的生物信息学转录组专题研讨班于近日圆满结束,该班获得学员们的一致好评。为了满足广大学员对该课程的需求,学院决定增开一期转录组专题研讨班。本期研讨班以转录组为主题,着重从工作中的实际需要出发,立足于实践,选取研究中的真实案例加以分析,并配合研究中所需的要点,围绕实际研究中常用的软件展开探讨,力求给您的研究带来最直接有效的帮助。

课程主要分为三部分:

一、以设计实例以及对实际问题的分析为引线,介绍转录组分析的各项知识要点;

二、学习及练习常用分析软件的使用方法,从而使学员深刻理解并掌握转录组分析的要点;

三、通过一个实际项目的演练,将课程各项知识点融会贯通,以达到真正掌握转录组分析的目的。

       实践设备----充足;实践操作---独立;实际案例----分享;

       满足你的独立动手能力、独立解决问题能力,让你学会如何将所学知识应用到实际研究中,学习到书本知识与实际应用中的差异,从而了解并获得更多的项目经验。

 

主办单位:深圳华大基因学院

举办地点:中国深圳

培训时间:2012年12月19-12月21日

 

课程安排:

 

专题

课程内容

授课时间

费用

转录组

12.19-12.21

1、  RNA分析背景及前沿技术介绍

1h

2800元

2、 转录组定量分析

2.1  三种定量分析方法介绍(DGE、芯片、RNA-seq)

2.2  表达量注释及差异基因筛选

2.3  go和kegg注释

2.4  项目设计讨论

3h

3、   有ref的转录组分析

3.1  ref分析的背景及其应用

3.2  实验建库原理

3.3  clean data比对

3.4  表达量计算

3.5  SNP检测

3.6  RNA编辑分析

3.7  可变剪切分析

3.8  基因融合的检测

3.9  ncRNA分析

3.10 项目设计讨论

8h

4、   没有参考序列的denovo分析

4.1  denovo背景介绍

4.2  常见组装软件介绍及软件性能分析

4.3  功能注释:NR、KEGG、SWISSPROT、COG

4.4  CDS预测

4.5  项目设计讨论

8h

5、   RNA分析的案例讲解及方案研讨

4h

 

【注】:深圳华大基因学院保留对以上课程信息(包括主题、课程安排和其他细节等)进行调整的权利,具体课程信息以实际上课为准。

 

【讲师团队】

       我们的讲师来自工作一线,项目经验丰富,多次参与重大项目和论文撰写,有开发生物信息学软件的宝贵实战经验,对生物信息学有全面了解和深刻认识。每个专题主讲一人,助教四名,同时指导项目讨论及辅导实践上机。

 

易康:华大基因研究院生物信息部-生物医药&疾病健康部门负责人

主要研究方向为RNA分析,已负责完成RNA流程和技术开发;

已在nature系列杂志上发表文章两篇,Cell Research上发表文章一篇;

华大基因学院专职讲师,培训经验丰富,责任心强,讲解细致,举一反三。

1,Ren S, Peng Z, Mao JH, Yu Y, Yin C, Gao X, Cui Z, Zhang J, Yi K, Xu W, Chen C, Wang F, Guo X, Lu J, Yang J, Wei M, Tian Z, Guan Y, Tang L, Xu C, Wang L, Gao X, Tian W, Wang J, Yang H, Wang J, Sun Y. RNA-seq analysis of prostate cancer in the Chinese population identifies recurrent gene fusions, cancer-associated long noncoding RNAs and aberrant alternative splicings. Cell Research. 2012 May;22(5):806-21. doi: 10.1038/cr.2012.30. Epub 2012 Feb 21

2, Aaron R Jex, Bo Li, Shiping Liu, Linfeng Yang, Zijun Xiong, Yingrui Li,Cinzia Cantacessi,Ross S Hall,Xun Xu,Fangyuan Chen,Xuan Wu,Adhemar Zerlotini,Guilherme Oliveira,Andreas Hofmann,Guojie Zhang,Xiaodong Fang,Yi Kang,Bronwyn E Campbell,Alex Loukas,Shoba Ranganathan, David Rollinson,Gabriel Rinaldi,Paul J Brindley,Huanming Yang,Jun Wang, Jian Wang& Robin B Gasser,et al.Whole-genome sequence of Schistosoma haematobium. Nature Genetics,Volume:2012 Jan 15;44(2):221-5. doi: 10.1038/ng.1065.

3,Aaron R. Jex, Shiping Liu, Bo Li, Neil D. Young,Ross S. Hall, Yingrui Li, Linfeng Yang, Na Zeng, Xun Xu, Zijun Xiong, Fangyuan Chen, Xuan Wu, Guojie Zhang, Xiaodong Fang, Yi Kang,Garry A. Anderson, Todd W. Harris, Bronwyn E. Campbell, Johnny Vlaminck, Tao Wang, Cinzia Cantacessi, Erich M. Schwarz, Shoba Ranganathan, Peter Geldhof, Peter Nejsum, et al. Ascaris suum draft genome. Nature, 2011, 479(7374):529-33.

 

【学员评价】

“讲课有条理,思路清晰,逻辑性强……”——中国科学技术大学李老师

“课程列举的相关案例分析,讲述明晰,讲师很用心……”——北京中医药大学李老师:

“讲师很有责任心和耐心,课程内容很丰富……”——中国科学院华南植物园王老师

“收获颇丰,不需此行;……”——中山医学院黄老师

“讲解的理论知识都设计了相应的上机操作,挺好;”中山大学耿老师

“讲师系统的整理了上机操作的常用命令,及上机操作指南……”中科院昆明植物研究所宋老师

 

【课程对象】

·从事RNA研究的工作者

·迫切希望提升RNA信息分析能力的工作者

 

【培训特色】

·高通量测序平台&高性能生物信息分析平台

·一流的讲师团队——丰富的软件研发经验、重大项目执行经验

·理论知识与项目设计相互结合,讲师授课与小组讨论共同进行

·精心挑选相应的上机软件,为每位学员提供实际操作的机会

 

【收费标准】

·注册费:含学费、资料费、上机费、其他材料费;

·培训期间可免费提供工作餐,可协助安排住宿,住宿费用自理。

特别说明:本次课程限定名额25名,为确保培训资源得到最佳利用,请尽快申请报名参加。

 

【优惠政策】

·华大基因长期合作伙伴可用积分兑换抵减注册费;

·4+1团体优惠,即同一单位有4人同时报名参加该期培训班,可额外赠送1个名额(只限于同一期培训班);

·套票政策:

 

套餐类型 培训卡数(张) 赠送培训卡(张) 培训卡金额(元/张) 购买总金额(元)
A 150 17 200 30000
B 250 44 200 50000
C 500 125 200 100000
D 750 250 200 150000

 

培训卡适用于华大基因学院任意一期培训班。

以上优惠不能同时使用,最终优惠解释权归华大基因所有!

凡华大基因生物信息学培训班老学员,可再享受9.5折优惠。

 

【注意事项】

·      已经成功付款的学员,如在2012年11月17日前联系主办方撤销席位,可退还100%的注册费用;如在开课前3个工作日内(含3个工作日)要求撤销席位则退还80%的注册费用。

·      因故不能如期参加本次培训班学员可提交延期申请,参加2012年09月-2013年09月期间由深圳华大基因学院举办的各类培训,费用将采取多退少补原则。逾期不参加任何培训课程可申请退款,退款期间产生的所有费用由学员本人承担。

 

【联系方式】

·联系电话:0755-25273851 培训中心(咨询时间:周一至周五9:00-18:00)

·E-mail:training@service.genomics.cn

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