会议介绍

 


        为了给微生物研究领域的您带来更实用的分析软件,使您能够与同领域的学者探讨专业问题,拓展思路,并获得同领域专家(华大微生物方向专家团队)的指导,华大基因特开设“微生物专题培训班”,为您打造一场全新的微生物专题盛宴!

【课程优势】

Ø 结合你的研究方向与华大基因的专家一起探讨研究中的瓶颈问题

Ø 结识微生物研究领域的其他专家研究者、与同行交流以拓宽自己的研究思路

Ø 掌握微生物相关常用分析软件的使用方法

【课程结构及内容】

Ø 以设计实例以及对实际问题的分析为引线,介绍微生物分析相关的各项知识要点;

Ø 学习及练习常用分析软件的使用方法,从而使学员深刻理解并掌握微生物相关分析的要点;

Ø 通过实际项目的演练,将课程各项知识点融会贯通

【培训特色】

Ø 一流的讲师团队——丰富的软件研发经验、重大项目执行经验

Ø 理论知识与项目设计相互结合,讲师授课与小组讨论共同进行

Ø 立足实践,选取研究中的真实案例加以分析

Ø 配合研究中所需的要点,围绕实际研究中常用的软件展开练习  

Ø 从工作中的实际需要出发,精心挑选相应的上机软件

Ø 为学员提供实际操作的机会,给您的研究带来最直接有效的帮助

欢迎报名参加微生物专题培训班,让我们在这里共同探讨和挖掘微生物资源的科学研究价值和应用前景。

 

主办单位:深圳华大基因研究院

举办地点:中国 深圳

培训时间:2014年7月16日-7月18日   

时间

课程

时长

第一天

1、微生物组学研究趋势与方法

   1.1 单菌不同水平(如DNA、RNA、蛋白等)的研究趋势和方法

   1.2 微生物群落(如16S、18S、宏基因组、宏转录组等)的研究趋势和方法

   1.3  如何利用这些组学研究的内容:

      a)设计文章思路  

      b)加速解决科学问题

3h

2、单菌的序列组装和功能分析---DNA水平 

   2.1 如何利用和比较illumina和454数据在单菌序列组装上的优缺点。(上机实操)

   2.2 如何利用Sanger测序的结果进行PCR补洞

   2.3 基于组装好的序列进行组分(基因、功能元件、非编码RNA等)和功能分析

   2.4 上机实操(以细菌和真菌基因预测、常用数据库的信息挖掘为主)             

5 h

第二天

3、单菌转录组和小RNA分析---RNA水平 

   3.1 常规转录组和链特异性转录组的分析内容和方法(上机实操)

   3.2 微生物小RNA分析内容和方法

   3.3 讨论如何联合DNA和RNA分析结果形成真正的trans研究 

      (如整体的调控网络)                       

3.5 h

 4、微生物群体项目分析

4.1 如何利用比较基因组学分析指导和挖掘群体中的规律

   (包括流行病学的溯源、植物病原菌的传播和进化等)

4.2 上机实操(共线性分析、构建系统发生树、基因家族分析)

4.5 h

第三天

 5、微生物群落结构分析

5.1 细菌群落组成分析内容和方法 (基于16S高变区,上机实操以多样品比较为主)

    5.2 真菌群落组成分析的趋势(主要基于ITS)

4h

 6、分享微生物相关经典案例、精品文章和项目设计经验

3h 

【注】:深圳华大基因研究院保留对以上课程信息(包括主题、课程安排和其他细节等)进行调整的权利,具体课程信息以实际上课为准

 

【常见问题】

·本期培训班授课的软件分别有哪些?

 主要涉及的软件有组装分析的SOAPdenovo 和Newbler;基因预测的Glimmer和GenMark-ES;多序列比对分析的MUSCLE和MUMMER;构建系统发生树的Treebest;基因家族分析的QrthoMCL;16S分析的mothur等。

·本期课程内容是否包含454测序数据分析内容?

  本期培训班的内容包括454测序数据分析内容。

·课程内容是否包含相关论文写作的技巧?

 培训班的内容不包括论文写作的技巧,但会涉及到如何利用组学研究的结果进行数据挖掘和文章的设计。

·参加完本期培训是否可以达到独立进行微生物数据分析能力?

 培训效果因学员自身专业背景不同而有区别,大部分学员基本可以掌握课堂所教授软件的用法。

 

【讲师团队】 

我们的讲师团队由微生物领域的专家及来自工作一线的技术主力共同组成,项目经验丰富,多次参与重大项目和论文撰写,具备开发生物信息学软件的宝贵实战经验,对生物信息学有全面了解和深刻认识。 

戴文魁:深圳华大基因科技服务有限公司微生物研究部总监,曾任微生物研究解决方案组组长及工农业微生物研究部负责人;一直致力于微生物组学数据的解读和挖掘,并针对不同研究领域的科学问题进行应用;近年来多次参与各种国内外教育教学培训、学术研讨会。华大基因学院特聘顾问及专职讲师,教学经验丰富,责任心强,讲解细致,举一反三。

1、Li Li, Wenkui Dai, et al (2008). “Decolorization of synthetic dyes by crude laccase from Rigidoporus lignosus W1.” Journal   of   Chemical   Technology   and   Biotechnology. 

2、Kehou Pan, Junjie Qin, Wenkui Dai, et al (2011). “NUCLEAR MONOPLOIDY AND ASEXUAL PROPOGATION OF NANNOCHLOROPSIS OCEANICA  SUDA & MIYASHITA (EUSTIGMATOPHYCEAE) AS REVEALED BY ITS GENOME SEQUENCE.” Journal of Phycology.

3、Min Guo, Xifang Han,..,Wenkui Dai, et al (2012). “Genome Sequences of Three Species in the Family Planctomycetaceae”. Journal of Bacteriology.

4、Dongbo Liu, Jing Gong, Wenkui Dai, et al (2012). “The Genome of Ganderma lucidum Provide Insights into Triterpense Biosynthesis and Wood Degradation.” PLoS One.

 

【收费标准】

·注册费:3600元/人,含包括学费、资料费、上机费、其他材料费;

·培训期间可免费提供工作餐,可协助安排住宿,住宿费用自理。

·特别说明:本次课程限定名额30名,为确保培训资源得到最佳利用,请尽快申请报名参加。

【课程对象】

·从事生命科学、生态学等领域科研工作者和高校教师及研究生

·对生物信息学有一定了解

【优惠政策】

·4+1团体优惠,即同一单位有4人同时报名参加该期培训班,可额外赠送1个名额(只限于同一期培训班)。

【注意事项】

·已经成功付款的学员,如在2014年7月12日前联系主办方撤销席位,可退还100%的注册费用;如在开课前3个工作日内(含3个工作日)要求撤销席位则退还80%的注册费用。

·撤销席位后,学员可提交延期申请,参加2014年7月-2015年7月期间由深圳华大基因研究院举办的各类培训,费用将采取多退少补原则。逾期不参加任何培训课程可申请退款,退款期间产生的所有费用由学员本人承担。

 

【联系方式】

·联系电话:0755-25273851 郑老师 李老师(咨询时间:周一至周五9:00-18:00)

·E-mail:training@service.genomics.cn

·官方网址:http://events.genomics.cn/training/show_training?id=159

·如有任何疑问请发邮件至training@service.genomics.cn 或 留言 。

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