会议介绍

 第二期多组学实战培训系列之转录组---暑期培训开始接受报名,本期讲座分为: A)有参考基因组,B)无参考基因组两个主题,以实际案例上机为主,讲解各种转录组学数据的实用分析和图表绘制方法。特邀讲师包括SCI杂志审稿人在内,在生物信息及分子动力方向皆具备欧美十余年的科研项目经验,任职于复旦大学和华东师范大学。培训旨在通过实践学习整合多组学数据的分析方法,解读生物学意义以及SCI论文释疑。

主办单位

上海计算技术研究所

承办单位

金弗康生物科技(上海)有限公司

生工(上海)生物工程有限公司 (上海著名商标)

时间、地点

培训时间:2014年7月31日(周四)至8月3日(周日)

培训地点:上海计算技术培训中心

培训班学员颁发由上海计算技术培训中心出具的培训证书

培训日程:

A:有参考基因组7月31日,8月1日

B:无参考基因组8月2日,8月3日

日期 时间 授课题目 授课内容
7月31日(周四)
A主题
08:30-09:30
1h
报到
开班仪式
安装软件
测试网络
09:30-11:30
2h
转录组学实验操作
讲座
具体介绍转录组学实验中的各个步骤,包括样品处理,质量控制,上机准备等
13:00-15:00
2h
转录组学
上机实践

1. 原始数据格式

2. 数据质量评估

3. 参考基因组获取和准备

4. 参考基因组比对分析

5. SNP分析
15:00-17:30
2.5h
 

6. 基因表达水平计算分析

7. 新转录本预测

8. 差异基因筛选

9. GO富集分析

10. KEGG富集分析
8月1日(周五)
A主题
08:30-11:30
3h
 

11. 蛋白互作分析

12. 转录因子预测分析

13. 调控模型构建
13:00-14:30
1.5h
  14. 可变剪切分析
14:30-16:30
2h
  15. 共表达分析和绘图
16:30-17:30
1h
总结答疑  
8月2日(周六)
B主题
08:30-9:30
1h
转录组学
上机实践

1. 原始数据rawdata格式

2. 质量控制,获取cleandata
9:30-11:30
2h
  3. 拼接:Velvet、Trinity等不同拼接软件的应用
13:00-15:00
2h
 

4. 获取有效unigene

5. 对unigene进行注释和COG分析
15:00-16:30
1.5h
 

6. unigene表达量计算

7. 预测CDS编码区
16:30-17:30
1h
总结答疑  
8月3日(周日)
B主题
08:30-9:30
1h
转录组学
上机实践

8. 进行GO分析

9. 进行Pathway分析
9:30-11:30
2h
 

10. 差异表达筛选并寻找组间差异(2组以上)

11. SNP分析
13:00-14:00
1h
  12. 转录因子预测
14:00-16:30
2.5h
 

13. lncRNA预测

14. lncRNA靶基因预测

15. 互作分析,建模
16:30-17:30
1h
SCI从撰写到投稿
由SCI杂志审稿人主讲
16. SCI论文写作技巧,投稿和回复审稿人意见

注:

1.课程具体安排以报名当天的课程表为准。

2.硬件环境:电脑i5配置,服务器支持,网速100兆(学员无需自备电脑)

收费标准(含培训资料和午餐):

A主题1800元/人

B主题1800元/人

A+B双主题3300元/人

两人优惠价格:单主题3300元,双主题6000元

三人优惠价格:单主题4800元,双主题8900元

其他事项

  1. 培训证书和发票于培训结束前发放

  2. 7月27日报名截止,培训班视收到学员培训费汇款信息凭证(截图、扫描件)为成功报名,并根据按学员付款先后顺序安排上课及上机位置

  3. 交通住宿费用自理,住宿需提前一周预定。住宿建议:

    1)如家快捷:陕西北路1738号,协议价:标间/大床215元T:02162999718

    2)如家快捷:中山北路2052号(3,4,7号地铁镇坪路站旁),协议价:标间/商务大床 212元T:02152901999

付款方式:

汇款至 金弗康生物科技(上海)有限公司

账户号: 121910757110501

开户行: 招商银行股份有限公司上海东大名支行

转账或者汇款时请仔细核对账户名称及账号,并在汇款用途处注明:培训班+姓名+手机尾号

联系方式:陈老师

联系电话:02133938669

信箱:yun.chen@geneforhealth.cn

交通方式:

上海市宜昌路575号(地铁3,4,7号线镇坪路站5分钟步行路程)

会议地图