第二期多组学实战培训系列之转录组---暑期培训开始接受报名,本期讲座分为: A)有参考基因组,B)无参考基因组两个主题,以实际案例上机为主,讲解各种转录组学数据的实用分析和图表绘制方法。特邀讲师包括SCI杂志审稿人在内,在生物信息及分子动力方向皆具备欧美十余年的科研项目经验,任职于复旦大学和华东师范大学。培训旨在通过实践学习整合多组学数据的分析方法,解读生物学意义以及SCI论文释疑。
上海计算技术研究所
金弗康生物科技(上海)有限公司
生工(上海)生物工程有限公司 (上海著名商标)
培训时间:2014年7月31日(周四)至8月3日(周日)
培训地点:上海计算技术培训中心
培训班学员颁发由上海计算技术培训中心出具的培训证书
A:有参考基因组7月31日,8月1日
B:无参考基因组8月2日,8月3日
日期 | 时间 | 授课题目 | 授课内容 |
---|---|---|---|
7月31日(周四) A主题 |
08:30-09:30 1h |
报到 开班仪式 |
安装软件 测试网络 |
09:30-11:30 2h |
转录组学实验操作 讲座 |
具体介绍转录组学实验中的各个步骤,包括样品处理,质量控制,上机准备等 | |
13:00-15:00 2h |
转录组学 上机实践 |
1. 原始数据格式 2. 数据质量评估 3. 参考基因组获取和准备 4. 参考基因组比对分析 5. SNP分析 |
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15:00-17:30 2.5h |
6. 基因表达水平计算分析 7. 新转录本预测 8. 差异基因筛选 9. GO富集分析 10. KEGG富集分析 |
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8月1日(周五) A主题 |
08:30-11:30 3h |
11. 蛋白互作分析 12. 转录因子预测分析 13. 调控模型构建 |
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13:00-14:30 1.5h |
14. 可变剪切分析 | ||
14:30-16:30 2h |
15. 共表达分析和绘图 | ||
16:30-17:30 1h |
总结答疑 | ||
8月2日(周六) B主题 |
08:30-9:30 1h |
转录组学 上机实践 |
1. 原始数据rawdata格式 2. 质量控制,获取cleandata |
9:30-11:30 2h |
3. 拼接:Velvet、Trinity等不同拼接软件的应用 | ||
13:00-15:00 2h |
4. 获取有效unigene 5. 对unigene进行注释和COG分析 |
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15:00-16:30 1.5h |
6. unigene表达量计算 7. 预测CDS编码区 |
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16:30-17:30 1h |
总结答疑 | ||
8月3日(周日) B主题 |
08:30-9:30 1h |
转录组学 上机实践 |
8. 进行GO分析 9. 进行Pathway分析 |
9:30-11:30 2h |
10. 差异表达筛选并寻找组间差异(2组以上) 11. SNP分析 |
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13:00-14:00 1h |
12. 转录因子预测 | ||
14:00-16:30 2.5h |
13. lncRNA预测 14. lncRNA靶基因预测 15. 互作分析,建模 |
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16:30-17:30 1h |
SCI从撰写到投稿 由SCI杂志审稿人主讲 |
16. SCI论文写作技巧,投稿和回复审稿人意见 |
1.课程具体安排以报名当天的课程表为准。
2.硬件环境:电脑i5配置,服务器支持,网速100兆(学员无需自备电脑)
A主题1800元/人
B主题1800元/人
A+B双主题3300元/人
两人优惠价格:单主题3300元,双主题6000元
三人优惠价格:单主题4800元,双主题8900元
培训证书和发票于培训结束前发放
7月27日报名截止,培训班视收到学员培训费汇款信息凭证(截图、扫描件)为成功报名,并根据按学员付款先后顺序安排上课及上机位置
交通住宿费用自理,住宿需提前一周预定。住宿建议:
1)如家快捷:陕西北路1738号,协议价:标间/大床215元T:02162999718
2)如家快捷:中山北路2052号(3,4,7号地铁镇坪路站旁),协议价:标间/商务大床 212元T:02152901999
汇款至 金弗康生物科技(上海)有限公司
账户号: 121910757110501
开户行: 招商银行股份有限公司上海东大名支行
转账或者汇款时请仔细核对账户名称及账号,并在汇款用途处注明:培训班+姓名+手机尾号
联系电话:02133938669
信箱:yun.chen@geneforhealth.cn
上海市宜昌路575号(地铁3,4,7号线镇坪路站5分钟步行路程)
会议结束
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