会议介绍


组学数据化的分析与挖掘研讨班  
 

    您是否还在苦恼如何通过GO/KEGG/DAVID注释的目的找出基因表达与疾病的关系? 
    您是否知道怎样做靶基因、转录因子和增强子的预测,及如何从这些预测的数据中锁定待研究的靶标?将帮您解决您的苦恼与疑惑! 
    本期培训班以生物医学基因组数据分析为主题,从学员的实际问题出发,详细讲解该领域常用的研究方法,结合实际上机操作系统学习分析软件的使用和图表绘制方法,真正解决您的科研苦恼与困扰。赶快来参加我们的培训班吧。真诚的欢迎您的到来! 
主办单位:
北京市计算中心(生物计算事业部) 
               
中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专业委员会 
培训地点:
北京海淀区丰贤中路7号3号楼,北京市计算中心三层会议室 
本次课程时间:
2016.8.23-8.26(火热报名中) 
上课时间:
上午:9:00 - 12:00  下午:1:30 – 5:30


日期

时间

课程名称

课程内容

第一天

上午

人类基因组测序、数据库、全基因组关联分析

  • Linux基础与常用命令

  • 人类基因组测序及生物信息学分析理论基础

  • 人类基因组与遗传变异数据库、数据资源获得

  • 全基因组关联分析(GWAS)理论与实践、低覆盖度测序+基因型填充原理

下午

基因组重测序与GWAS数据分析

  • 对二代测序数据的解读及数据质量控制及数据过滤

  • 使用BWA和Samtools进行数据比对及结果IGV可视化

  • 寻找SNP和Indel并进行注释

  • 基因组变异ANNOVAR功能注释

  • 关联分析软件Plink、Haploview等软件使用

第二天

上午

生物信息学专业常用工具及科研绘图

  • Bioedit与生物信息序列处理

  • Blast与序列检索比对及参数、Blast建库与Blast本地化

  • Mega的使用及系统发育分析

  • 分子网络分析工具Cytoscape使用

  • 运用生物信息常用的工具进行专业绘图及格式转换

下午

蛋白结构基础及常用工具软件

  • 蛋白质结构分析与PDB数据库应用

  • PDB文件格式概述

3.常用蛋白结构分析软件应用(VMD,Pymol等)

第三天

上午

转录组数据分析上机操作

  • 转录组数据准备和软件介绍及安装

  • 转录组数据的比对(重点讲解)

  • 表达量估计和分析(重点讲解)

  • 使用DAVID进行功能分析与基因浏览器

下午

RNA-seq与基因表达与疾病的关系

1.转录组与小RNA测序在人类医学中应用 
2.基因表达与人类医学数据分析 
3.基因本体数据及GO注释 
4.生物学通路KEGG注释方法与实现

第四天

上午

转录组学测序技术

  • 从转录组数据发现SNPs

  • 从转录组数据预测lncRNAs

下午

TCGA项目及数据应用

  • TCGA项目及数据介绍

  • TCGA数据在医学应用中的案例分析

 

(课程内容以实际授课为准)
注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。 
特色:

  • 一线讲师团队,具有丰富的项目经验

  • 理论知识与上机操作相结合,为每位学员提供实际操作机会

  • 增值服务, 课下主讲老师将为您实际工作中遇到的问题提供个性化解答

  • 小班教学,每期培训班的人数不超过35人。

报名费用: 
注册费4800元,含听课费、资料费、上机费和午餐。请自带笔记本电脑用以上机实习。所有学员自动成为VIP会员,永久享受生物计算分析服务9折优惠。 
【报名优惠政策】 
1、3人以上团体报名每人可减少300元; 
2、4+1团报,可免费赠送一个名额 
3、上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。 
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。